پوهنتون کاردان برنامه ماستری در مدیریت پروژه های ساختمانی را ایجاد نموده است. این برنامه به زبان انگلیسی تدریس می‌گردد . برنامه ماستری مدیریت پروژه ساختمانی به منظور رفع نیازمندی کشور به مدیران مسلکی در عرصه ساخت و ساز و با هدف تربیه نیروی کار متخصص جهت پیشبرد توسعه اقتصادی و اجتماعی در افغانستان ایجاد شده است.
ایجاد این برنامه ماستری، پوهنتون کاردان را در راستای تحقق هدف استراتژیک این پوهنتون که همانا ارائه تحصیلات با کیفیت، قابل دسترس و مطابق به نیازمندی های مبرم جامعه است، کمک خواهد نمود.همچنان برنامه ماستری مدیریت در پروژه های ساختمانی برای آن عده از فارغان رشته انجنیری که به دنبال شروع و یا رشد کار شان درعرصه صنعت ساختمانی هستند، یک فرصت استثنایی را ایجاد خواهد نمود.